Bist du sicher das es eine INK-Datei und keine LNK-Datei ist (L statt I)?
LNK sind nämlich Verknüpfungen (Links) und sollte da irendetwas an den Windows-Einstellungen falsch sein würde das erklären, warum sich die Ordner nicht mehr über die Verknüpfungen öffnen lassen.
Wenn das Problem erst seit kurzen besteht, dann kannst du es einfach mal mit einer Systemwiederherstellung versuchen. Über die Systemwiederherstellung kannst du die Windowseinstellungen auf einen Zeitpunkt zurücksetzen, bevor das Problem das erste mal aufgetaucht ist.
Voraussetzung dafür ist jedoch, das ein Systemwiederherstellungs-Zeitpunkt existiert, der vom Datum vor dem ersten Auftauchen des Problems liegt.
Die Systemwiederherstellung findest du unter
WinXP:
Systemsteuerung -> (evtl. zur Kategorieansicht wechseln) -> Leistung und Wartung -> Systemwiederherstellung (oben links)
Vista:
Systemsteuerung -> Sichern und Wiederherstellen -> Windows mittels der Systemwiederherstellung reparieren (oben links)
Win7:
Systemsteuerung -> System und Sicherheit -> Sichern und Wiederherstellen -> Systemeinstellungen auf dem Computer wiederherstellen (gaaanz unten)
Einfach dort einen passenden Wiederherstellungszeitpunkt auswählen und dem Assistenten folgen.
Ansonsten wenn es sich um fehlerhafte LNK und nicht um INK Dateien handelt, könnte auch folgender Tipp helfen:
http://www.wintotal.de/tipparchiv/?id=921
